> Однако нельзя не отметить, что невыплата отдельной зарплаты может и составляет 0,01% от бюджета страны в целом, но для каждого конечного не получившего зарплату работника эта сумма составляет уже 100%.

Да это-то понятно.
Вопрос в другом - можно ли это считать свидетельством какого-то системного сбоя, или, скорее всего, это незначительная флуктуация, вызванная какими-то случайными причинами.
В данном случае мы имеем дело с показателем, находящимся глубоко внутри статистической погрешности - даже не в сравнении с расходами бюджета целиком, а и с суммой зарплат бюджетников за тот же период.